我国的医事制度从周代开始就比较健全了。据《周礼》记载：当时设有医师、上士、下士、府、史、徒若干人。下分食医（掌管饮食）、疫疾（掌养刁民之疾病）、疡医（主治肿疡、溃疡、金疡等病）、兽医等类。“医师”为众之长，掌握医疗政令，每年年终进行考核，所谓“岁冬则稽其事，以制其食”，即每年增减奉禄都要评比考核。当时患者经医治后，都要建立医案，死者要有报告交待。此外还有掌握环境卫生的职官。

秦代医事制度基本同周代相同。

汉初设太医令丞、属少府。后汉时设掌握医事的太医令一人，下辖计员医、药丞300多人。药丞主药，方丞主药方。凡官府各部均置官医，考选补用均由太医令主管。

隋代时，太医令改属门下省，门下省设尚药局。有典御、侍御医、直长、医师46人，另有大医署，有令、丞、主药、药园师、医博士、助教、按摩博士、祝禁博主和医师等职称。它既是当时国家最高医学教育机构，同时也担负一定的医疗职能。唐代基本因袭隋制有所发展，另置药藏局，是东宫内医疗机构。

宋代的医事制度比隋唐有所发展。设有太医局和翰林医官院。太医局以培训医疗方面的人才为主，翰林医官院设大小方脉，眼、产、口腔、肿瘤等科。另设御药院、尚药局掌管皇家药物。宋代还很重视医药人才的培养，每年春季招考300名合格者，并送到太学、律学、武学各营轮流实习，年终评比，合格者则授予尚药局医师职务。在民间医药设施方面，京师设有太药局卖药所，后各地也相应设立。

元代设太医院、医学提举司、官医提举司等机构。明初设有医学提举司，后改为太医院。并在地方设惠民药局，府设提领，州县设官医，凡军民疾病，均予医药。太医院掌医药之法，分十三科。清沿明制，光绪时又改革医疗机构，民政部下设卫生司，陆军、海军部设军医司，法部设监医正、监医副。明清时期的制药业也相当发达，如北京在明代就有了著名的制药店——西鹤年堂。从明代起还在全国设立了多处药物集市，其中以河北茂州祁州药市最为著名。